1756 年，上埃及
十名马姆鲁克骑兵决定杀死年轻修士，立刻冲上前去，缴械后的被害人面对这群职业杀手几乎毫无还击之力。这些骑兵为一名地方上的小霸王效力，以主人做后盾到处敲诈勒索。
年轻修士塔摩斯怎么料想得到，在这空旷的沙漠中竟会遭到一群杀手攻击？通常他总是面对夕阳静坐，回想恩师赫梅斯──一位精力充沛得惊人的老者──的教诲，时间从沙丘底下流失，无垠的寂静几乎不受朱鹭的飞翔惊扰，永恒的美油然而生。
塔摩斯跑得上气不接下气。熟悉地形是他的一大优势，他尽可能加以利用。他像羚羊般轻盈纵身，越过一道干河床，然后爬上岩石遍布的山坡。
追赶在后的马姆鲁克过于肥胖，已是汗如雨下。其中一人扭伤脚踝，跌倒时还拖累三名同伴。其余几人继续朝那头精力源源不绝的该死猎物猛追，咒骂连连。
塔摩斯绕过一片流沙，却有两名马姆鲁克陷入其中，同伴们急着抢救。有个骑兵怒火中烧，不肯放弃，眼看修士就要逃掉，恼恨地将军刀投射出去。只差一点便击中目标。
塔摩斯继续奔跑许久，并尽量避开修道院方向，以免使其遭险。最后他气喘吁吁地跪倒在一棵金合欢树下，感谢上帝。若非上帝相助，他无法逃出魔掌。
精神恢复后，修士开始往回走，一面留意那些马姆鲁克是否也已折返。他们习惯于轻而易举地获胜，对于沙漠的恶灵心有戒惧，总不愿在沙漠中逗留。
天黑时，塔摩斯回到设防的圣梅古利修道院。他从小便和另外11 名修士住在这里，如今他们皆已上了年纪。
“你终于回来了！发生什么事了？”
“我在躲避一群攻击者。”
守门人离开监视岗位，拉开修道院大门。他带塔摩斯去见赫梅斯院长时，院长正专注地读着写满象形文字的纸莎草纸文稿。老院长年近百岁，将房间改为藏书室后几乎足不出户。书架上摆的都是埃及在法老治下那段光辉昌盛时期的文献。
此时，奥斯曼帝国的暴政正大肆蹂躏，消灭拜占庭、征服近东之后，如今直逼欧洲。伊斯兰象征着唯一且绝对的真理，难道不该成为全世界人的信仰？土耳其的军事力量终能将它发扬光大。
埃及人遭重税压榨、备受虐待，苦不堪言。帕夏任由开罗的贝伊为所欲为、剥削民脂，并放纵手下士兵互相残杀，目前由武装完备又凶残的马姆鲁克军队居于上风。苦难、饥荒与传染病紧掐着上埃及与下埃及，美丽辉煌的亚历山大城仅剩8000居民。
自从7世纪阿拉伯人入侵以来，这群摧毁无数古老神殿，让女人蒙上面纱、从此被视为次等生物，并将葡萄树连根拔起的人，似乎忘了圣梅古利修道院的存在。
这座地处偏僻的小修道院有圣梅古利保护着。抢匪深信圣人那两把剑会从天而降割断自己的喉咙，因此不敢造次。
塔摩斯见到院长后，简要道出自己的惊险遭遇。
“时候到了。”老院长评估道，“圣梅古利恐怕已无法保护我们太久。”
“我们应该离开吗，神父？”
“孩子，你得走，但我们要留下。”
“我会保护你直到我流干最后一滴血！”
“你还有更重要的任务要去执行。跟我到炼金室来。”
自从最后一群修士与修女在伊西丝之岛菲莱上被屠杀后，再也没有人刻写过任何象形文字的文献，法老时期这种神奇文字的秘密似乎从此失传。
然而，这些秘密其实是由师傅以口述方式传给弟子，而赫梅斯院长正是这一脉相传的最后一环。
“他们会杀死我们，烧掉修道院。”他预言说，“从前，我们把宝物埋在沙中，现在我要将炼金术最后几个阶段告诉你，以免这项传统失传。”
炼金室是个类似古埃及金字塔内复活室的小房间，墙上有些象形文字记录着伊西丝如何将炼金术教给何露斯，同时让遭到谋杀的俄塞利斯死而复生。遭分尸后又恢复最初完整形体的俄塞利斯象征着光明战胜黑暗，是重生于黑夜核心的太阳。
“大麦也能变成黄金，”院长说道，“俄塞利斯便是点金石。象形文字会赋予你直觉，让你能够拥抱完整的真相，无论有形或无形。仔细看看伊西丝的杰作。”塔摩斯走过近路，永恒的瞬间光芒耀眼，他也走过长路，漫长的仪式结束后身心合一。
年轻修士将神语铭刻在心。
“经过1500年的等待，”赫梅斯院长说，“俄塞利斯终于允许大魔法师重生，化身为人，但不是在这里。他的神灵选择了北方寒冷的土地。当他出现后，将不再拥有我们伟大母亲所不可或缺的力量，因此你必须将伊西丝的智慧与《托特之书》传给他。你要帮助大魔法师自我建构，直到他能够传递奥义启蒙的秘密并照亮黑暗。”
塔摩斯脸色苍白，喃喃地说：“神父，我……”
“孩子，你别无选择。你若不成功，众神便将从此远离这块土地，俄塞利斯也不会再复活。学会了炼金术，你将能远行、供给自己所需、照应自己，也能说多种语言。”
“我多希望能留下来陪在你身边！”
“我们一起来做最后的祈祷，然后你就出发。塔摩斯，你要找到大魔法师，保护他，让他创造出象征希望的作品。